書きかけの記事でお見苦しい中 見ていただきありがとうございます。
現状任天堂の言う特許侵害の内容がわからないのでお答えしづらいのですが。
コロプラが取得した特許が特許侵害ならば そもそも特許庁の審査が通らず コロプラはその特許を取れない
とは言え それでも希に審査に通ることはありますが
その場合は 任天堂は特許無効を 特許庁に訴えるのではないかと推測されます。
それらの手続きをしている話は聞かないので(実際は わかりませんが)
現状では 任天堂が訴えてる特許侵害と コロプラが取得してる特許は 無関係だと 結論づけてます。